원균은 이순신 보다 나이가 5살이나 많은 상관 이었다.（군 경력 12년 상관）

그러나 서해 유성룡의 전라좌수사 부임자리에 이순신을 추천함으로 인하여 파격적인 7계급 특진을（현재에서도 그 유례를찾기힘듬） 하게된다. 계급상 원균은 이순신과 동급이 된것이다.

또한 하급군관 에 불과했던 사람이 자기와 동급이 되는것도 모잘라, 자기보다 위인 상관이 된다. （삼도수군통제사）

원균은 이런 점이 매우 못마땅했던 것 같다.

실제로 이순신의 군율에 반발 하는 사건이 난중일기에 고스란히 적혀있을 정도..

난중일기에 적힌 원균에 대한 이순신의 기록은 매우 좋지 않다.

이순신은 그를 불러 원흉, 흉악한자라고 했을뿐만 아니라 모친상을 당햇을 당시에도 그가 조문편지를 보낸건 순전히 권율이 시킨짓이라며 핏대를 세우기도했다.

실제로 난중일기 기록에 원균은 부장에 아녀자를 간음하기위해 부장을 멀리 보내려다 그 사실이 발각돼 웃음거리가 되었다 기록하고있다.

또한 원균의 만남과는 때를 잘못 만난 사람, 상종하기 싫은 짐승이라 까지 표현할 정도이다.

이순신은 나이가 많은 사람인 원균이 달마다 적개심 가득 담긴 반항에 대하기가 점점 힘들어 졌다.

토로하기도했다

이 둘의 사이는 원균이 이순신을 모함하여 원균 스스로 칠천량 해전에서 죽을때까지 끝내 풀어지지 못했다.